FAJAR.CO.ID, JAKARTA—Para peneliti yang memetakan beberapa penyebaran asli virus corona pada manusia telah menemukan ada varian virus di seluruh dunia. Mereka merekonstruksi jalur evolusi awal Covid-19 ketika infeksi menyebar dari Wuhan, Cina, ke Eropa dan Amerika Utara.
Dengan menganalisis 160 gen virus lengkap pertama yang diurutkan dari pasien manusia, para ilmuwan menemukan varian yang paling dekat dengan yang ditemukan pada kelelawar sebagian besar ditemukan pada pasien dari AS dan Australia, bukan Wuhan.
Dr Peter Forster, ahli genetika dan penulis utama dari University of Cambridge, mengatakan terlalu banyak mutasi yang cepat untuk melacak pohon keluarga Covid-19 dengan rapi. “Kami menggunakan algoritma jaringan matematika untuk memvisualisasikan semua pohon yang masuk akal secara bersamaan,” katanya dikutip dari Metro.
Teknik-teknik ini sebagian
besar dikenal untuk memetakan pergerakan populasi manusia prasejarah melalui
DNA. “Kami pikir ini adalah salah satu pertama kalinya mereka digunakan untuk
melacak rute infeksi virus corona seperti Covid-19,” jelasnya.
Tim menggunakan data dari sampel yang diambil dari
seluruh dunia antara 24 Desember 2019 dan 4 Maret 2020. Mereka menemukan tiga
varian Covid-19 yang berbeda, tetapi berkaitan erat, yang mereka sebut A, B dan
C.
Para peneliti menemukan bahwa jenis virus corona yang paling dekat dengan yang ditemukan pada kelelawar – tipe A, genom virus manusia asli – ada di Wuhan, tetapi bukan jenis virus utama di kota itu.
Versi mutasi A terlihat di
Amerika yang dilaporkan telah tinggal di Wuhan, dan sejumlah besar virus tipe A
ditemukan pada pasien dari AS dan Australia. Jenis virus utama Wuhan adalah B
dan lazim pada pasien dari seluruh Asia timur, namun tidak banyak bepergian di
luar kawasan tanpa mutasi lebih lanjut.
Para peneliti mengatakan varian C adalah tipe
Eropa utama, ditemukan pada pasien awal dari Prancis, Italia, Swedia dan
Inggris. Analisis ini juga menunjukkan salah satu perkenalan awal virus ke
Italia datang melalui infeksi Jerman yang pertama kali didokumentasikan pada 27
Januari, dan bahwa rute infeksi Italia awal lainnya terkait dengan ‘cluster
Singapura’.
Itu tidak ada dalam sampel
daratan Cina studi ini tetapi terlihat di Singapura, Hong Kong, dan Korea
Selatan. Para ilmuwan berpendapat metode mereka dapat diterapkan pada
sekuensing genom coronavirus terbaru untuk membantu memprediksi hotspot global
masa depan dari penularan dan penyebaran penyakit.
Temuan ini diterbitkan dalam jurnal Proceeding of
National Academy of Sciences (PNAS). Varian A, yang paling dekat hubungannya
dengan virus yang ditemukan pada kelelawar dan trenggiling, digambarkan sebagai
akar wabah oleh para peneliti.
Tipe B berasal dari A, dipisahkan oleh dua mutasi, kemudian C pada gilirannya adalah ‘anak perempuan’ dari B, penelitian menunjukkan. Metode jaringan filogenetik yang digunakan oleh para peneliti – yang melihat hubungan evolusi di antara entitas biologis – memungkinkan visualisasi ratusan pohon evolusi secara bersamaan dalam satu grafik sederhana. (Metro/amr)
Komentar